木瓜蛋白酶（Papain），又称木瓜酶，是一种蛋白水解酶。木瓜蛋白酶是番木瓜（Carieapapaya）中含有的一种低特异性蛋白水解酶，广泛地存在于番木瓜的根、茎、叶和果实内，其中在未成熟的乳汁中含量最丰富。木瓜蛋白酶的活性中心含半胱氨酸，属于巯基蛋白酶，它具有酶活高、热稳定性好、天然卫生安全等特点。
木瓜蛋白酶在肉类加工中：能使肉类嫩化，口感风味提高，经木瓜蛋白酶加工生产的嫩肉粉是健康天然的食品添加剂，脱水汤料的制作可使产品利用率更高；
木瓜蛋白酶在食品加工中，还用做饼干的蓬松剂，酱类食品的酿造，饮料澄清剂和酵母提取物等。
按照生产需要适量使用